Cikal bakal Fakultas Psikologi UGM adalah Jurusan Psikologi. Jurusan Psikologi merupakan bagian dari Fakultas Ilmu Pendidikan Universitas Gadjah Mada, yang berdiri pada tahun ajaran 1958/1959.

Berdasarkan Keputusan Bersama PTIP dan Menteri PDK tanggal 6 Mei 1964 No. 34 tahun 1964 dan No. 32 tahun 1964, maka Fakultas Ilmu Pendidikan UGM digabungkan dengan IKIP Yogyakarta. Oleh karena itu, Jurusan Psikologi di FIP UGM dipisah dan tetap tinggal di UGM. Jurusan Psikologi kemudian berubah nama menjadi Bagian Psikologi yang dipimpin langsung oleh Rektor UGM.

Kemudian pada tanggal 8 Januari 1965, berdasarkan Surat Keputusan Presiden RI menetapkan bahwa Bagian Psikologi UGM resmi menjadi Fakultas Psikologi Universitas Gadjah Mada mulai tanggal 19 Desember 1964. Selanjutnya, tanggal 8 Januari 1965 ditetapkan sebagai hari jadi Fakultas Psikologi UGM.

Dalam perjalanan sejarahnya, Fakultas Psikologi UGM telah mengalami beberapa kali pergantian pimpinan.